Lịch sử hình thành quần thể văn hoá đỉnh thiêng Bà Đen gắn liền với sự phát triển của Phật giáo và tín ngưỡng thờ mẫu tại Việt Nam, đặc biệt ở khu vực Tây Ninh. Nằm trên đỉnh núi Bà Đen, ngôi chùa chính là Linh Sơn Tiên Thạch Tự, được cho là có từ thế kỷ 18. Ban đầu, đây là một nơi tu hành của các nhà sư và đạo sĩ, sau đó dần trở thành điểm hành hương quan trọng, thu hút Phật tử và du khách khắp nơi.
Trong quá trình phát triển, khu vực này đã trải qua nhiều lần trùng tu và mở rộng, tạo nên một quần thể gồm nhiều chùa, đền, và các công trình kiến trúc tâm linh khác, mỗi nơi mang một giá trị lịch sử và văn hóa đặc sắc.